台灣基督長老教會台南中會南門教會 Tainan South Gate Presbyterian Church
自日據時代建會至今。因教友紀念亡夫而發起管風琴設置基金，石瓊玲老師陸續向父親石慶璋醫師募得 400 萬經費，教會籌措剩餘經費，歷經三年順利購置。
創立年代/Year of Establishment：1933年 攝影師/Photographer：蕭培賢/XIAO Pei-xian
•琴座/2層手鍵盤/1組腳鍵盤 Console/2 manuals/1 pedalboard
•廠牌/Label：德國森林教會樂器公司/Waldkircher Orgelbau Jäger & Brommer
•音管數/Number of pipes：702
•音栓數/Number of stops：15
•購入年代/Year of Purchase：2008年
真理大學台南麻豆校區真理堂 Aletheia University, Matou Campus, The Grand Chapel
以數字8為概念，於奧地利訂製的現代造特殊型管風琴，共有8個區域：木質風管區、四區金屬風管、銀星圖記、棒鈴區、西班牙啦叭區。
創立年代/Year of Establishment：1996年 攝影師/Photographer：蕭培賢/XIAO Pei-xian
•琴座/3層手鍵盤/1組腳鍵盤 Console/3 manuals/1 pedalboard
•廠牌/Label：Kaltenbrunner
•音管數/Number of pipes：2379
•音栓數/Number of stops：35
•特效音栓數/Number of special stop：1
•購入年代/Year of Purchase：：2005年
台灣基督長老教會鳳山教會 Fong-San Presbyterian Church
創會超過150年。在仿哥德式建築的教堂中，設有大型管風琴，亦可作為音樂會表演場地。
創立年代/Year of Establishment：1867年
攝影師/ Photographer：林峻永/LIN Chun-yung
•琴座/2層手鍵盤/1組腳鍵盤 Console/2 manuals/1 pedalboard
•廠牌/Label：佩爾斯管風琴廠/Pels & Van Leeuwen
•音管數/Number of pipes：978
•音栓數/Number of stops：11
•購入年代/Year of Purchase：2001年
台灣基督長老教會鼓山教會 Gu-Shan Presbyterian Church
教會長老張文章認定管風琴「就是教會應該有的聲音」，而全額奉獻，購置瑞士製管風琴。
創立年代/Year of Establishment：1946年 攝影師/Photographer：林峻永/ LIN Chun-yung
•琴座/2層手鍵盤/1組腳鍵盤 Console/2 manuals/1 pedalboard
•廠牌/Label：馬提斯/Mathis
•音管數/Number of pipes：1836
•音栓數/Number of stops：26
•特效音栓數/Number of special stops：1
•購入年代/Year of Purchase：2003年
