挑戰「亞洲金融風暴」 1997年，蕭萬長出任行政院長，他在院長任內遭遇亞洲金融風暴，股市從一萬兩千點跌至兩千點。 要在金融風暴中維持社會穩定，中央銀行堅持固守匯率，才是最好的辦法。經濟背景出身的他與中央銀行總裁許遠東商議，認為央行固守匯率將會損失慘重，央行應該放手讓市場機制決定匯率。 依循蕭萬長的建議，央行決定放手，結果新臺幣雖然數日內有所貶值，但貶值時間並不長，而且匯率是隨市場而調整，不受投機者影響。 中華民國成功與亞洲金融風暴對抗，這樣的經驗，也成為許多國家取經的對象。 挑戰「民主化下的政策改革」 蕭萬長擔任行政院長，正是李登輝獲選臺灣首任民選總統時所邀請。蕭萬長推出的施政、做法，受到大眾的矚目，而他也自許為「行動內閣」，期望能有效率、有行動力地打造臺灣未來的藍圖，像是他甫上任便推出亞洲金融中心的構想，推動經濟各項改革。 其次，面對時代與社會轉變，隨即推動對應政策，像是推動眷村改建計畫，藉此擴大國內需求、振興經濟。 又像是面對1997年國軍精實案，在以總統為三軍統帥、「精簡高層、充實基層」之下，過剩的役男問題，他不遺餘力地推動替代役制度，將過剩人力轉而投入促進公共利益的特定任務，替代服兵役的義務，也藉此提升政府行政的效率。 挑戰「基礎建設的邁進」 在臺灣建設高鐵是未來必須的趨勢，但如此龐大的投資標的、長時間的投入，只要稍有差池，就容易造成投資方的恐慌，功虧一簣。 就此，蕭萬長多次向各部會強調，政府要出面融資，讓民間企業願意相信政府，達成這次的高鐵BOT案。 尤其，面對金融風暴時，他要求各部會給予投資者最大的支持， 像是建立妥善的投資與風險機制，由政府出面承擔與保證，解決投資者的疑慮。在這樣優質的投資環境下，再加上他不斷信心喊話，總算度過這次危機。 最終，臺灣高鐵順利興建，並且在各方努力下，於2007年開始營運。蕭萬長是這麼認為的，若不是團隊的努力、投資者的信任、高鐵董事會的營運與氣魄，擔任「產婆」的他，將無法見證到臺灣高速鐵路在臺灣西部飛馳。
