《台灣人四百年史》付梓前，時值臺灣戒嚴時期，曾遭受企圖以直接向出版社購買版權來阻止出版的阻撓。史明為了掩人耳目，以筆名、偽造作者生平等方式，才藉由早稻田大學學弟開設的「音羽書房」出版。 史明不斷增補、修訂、改寫、改編《台灣人四百年史》。1974年出版日文版增補修訂本，1980年完成漢文版在美國出版，1986年出版英文版，1988年史明授權鄭南榕在臺灣出版、流通，1998年出版漢文增補版，2014年加筆修改再版。甚至還有漫畫版、簡明版等不同版本。因在出版期間受到美國舊金山灣區協志會的石清正許多協助，讓史明堅持這本書即使在日本印行，仍註明是在加州聖荷西出版。 《台灣人四百年史》不只是一本臺灣史著作，更紀錄了史明一生的思想轉變歷程。事實上，唯有將這本書放在史明革命行動中來綜合審視，才能理解他希望為臺灣人留下行動方針與參考指南的期許。
