到了19世紀，笨港的港務依舊繁盛，容納小船出入，所屬的腹地也快速擴展。 洪敏麟推估1803年前後北港溪的河道位置圖。此時分隔古笨港南、北街的北港溪，漸漸向東南移動，由於北港溪向南侵蝕的特性，導致許多原居於笨港南街的居民，紛紛越過北港溪，搬移至「笨港北街」生活，商業繁盛更勝以往，而「北港」之名逐漸取代了「笨港」的舊稱。同治初年《臺灣府輿圖纂要》稱「笨港（即北港）：距縣治西三十里，商旅輻輳，為海口要地。」光緒二十年（1894）《雲林縣採訪冊》則記載：「北港街即笨港，因在港之北，故名約北港。東、西、南、北共分八街，煙戶七千餘家。」「北港」已成為我們今天稱呼此地的名稱，而「笨港」則逐漸隱沒消逝在歷史之中。
