《台灣人四百年史》是史明從1950年就起心動念的行動，透過書寫，他想釐清的是「臺灣是什麼？」、「臺灣人又是什麼？」等問題。 1949年史明從中國返回臺灣以後，曾經和士林同鄉曹永和借閱參考資料，開始構想一本以臺灣人立場出發的臺灣史。不料後來因為革命行動敗露，於1952年流亡日本。從路邊擺攤開始，到開設「新珍味」餐館，史明白天忙於生計，夜晚則埋首書堆，利用閒暇前往日本國會圖書館、早稻田大學圖書館尋找資料，終於以兩年的時間在1962年出版《台灣人四百年史》日文版。
